Скрипт tex2htm.js позволяет набирать только простые формулы в одну строку. Но можно использовать таблицы для разметки формул с дробями. Подведите мышку к формуле и увидите требуемую организацию ячеек таблицы в строках.
$k=$ | $E_1$ | = | $w_1k_1$ | . |
$E_2$ | $w_2k_2$ |
Если ячейка должна занять две строки таблицы, то надо использовать атрибут rowspan="2".